Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARFGEF2Q9Y6D5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARFGEF2Q9Y6D5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARFGEF2Q9Y6D5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARFGEF2Q9Y6D5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARFGEF2Q9Y6D5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARFGEF2Q9Y6D5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARFGEF2Q9Y6D5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ARFGEF2Q9Y6D5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARFGEF2Q9Y6D5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARFGEF2Q9Y6D5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARFGEF2Q9Y6D5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARFGEF2Q9Y6D5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARFGEF2Q9Y6D5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARFGEF2Q9Y6D5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms