Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHA12Q9UN75 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHA12Q9UN75 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms