Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TNIKQ9UKE5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
TNIKQ9UKE5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TNIKQ9UKE5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TNIKQ9UKE5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
TNIKQ9UKE5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TNIKQ9UKE5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
TNIKQ9UKE5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TNIKQ9UKE5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
TNIKQ9UKE5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
TNIKQ9UKE5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TNIKQ9UKE5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TNIKQ9UKE5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TNIKQ9UKE5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TNIKQ9UKE5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TNIKQ9UKE5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TNIKQ9UKE5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TNIKQ9UKE5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TNIKQ9UKE5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TNIKQ9UKE5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
TNIKQ9UKE5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms