Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC17A6Q9P2U8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.4 ms