Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0B6

CCDC167, Coiled-coil domain-containing protein 167, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC167Q9P0B6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC167Q9P0B6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC167Q9P0B6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms