Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NECAP2Q9NVZ3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NECAP2Q9NVZ3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms