Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM42Q9BTD8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms