Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC36.33■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC36.26■■■■□ 3.4
TOPBP1Q92547 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TOPBP1Q92547 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.5 ms