Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ3

NLGN4Y, Neuroligin-4, Y-linked, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4YQ8NFZ3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NLGN4YQ8NFZ3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NLGN4YQ8NFZ3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NLGN4YQ8NFZ3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NLGN4YQ8NFZ3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NLGN4YQ8NFZ3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NLGN4YQ8NFZ3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NLGN4YQ8NFZ3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLGN4YQ8NFZ3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms