Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE23Q8NDY6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 505.5 ms