Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNE4Q8N205 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms