Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms