Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC33■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC33■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC33■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC33■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC33■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRC9Q6ZRR7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms