Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF1CQ15572 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms