Protein–RNA interactions for Protein: O95198

KLHL2, Kelch-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL2O95198 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL2O95198 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL2O95198 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL2O95198 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL2O95198 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL2O95198 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL2O95198 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL2O95198 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL2O95198 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL2O95198 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL2O95198 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL2O95198 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
KLHL2O95198 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL2O95198 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms