Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRPF40AO75400 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF40AO75400 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms