Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DFFAO00273 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DFFAO00273 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DFFAO00273 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DFFAO00273 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DFFAO00273 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DFFAO00273 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DFFAO00273 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DFFAO00273 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DFFAO00273 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DFFAO00273 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DFFAO00273 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DFFAO00273 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DFFAO00273 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DFFAO00273 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DFFAO00273 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DFFAO00273 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DFFAO00273 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DFFAO00273 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DFFAO00273 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DFFAO00273 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DFFAO00273 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DFFAO00273 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DFFAO00273 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DFFAO00273 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DFFAO00273 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DFFAO00273 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DFFAO00273 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DFFAO00273 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DFFAO00273 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DFFAO00273 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DFFAO00273 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DFFAO00273 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DFFAO00273 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DFFAO00273 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DFFAO00273 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DFFAO00273 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DFFAO00273 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DFFAO00273 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DFFAO00273 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DFFAO00273 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DFFAO00273 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DFFAO00273 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DFFAO00273 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DFFAO00273 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DFFAO00273 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DFFAO00273 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DFFAO00273 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DFFAO00273 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DFFAO00273 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DFFAO00273 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DFFAO00273 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DFFAO00273 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DFFAO00273 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DFFAO00273 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DFFAO00273 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DFFAO00273 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DFFAO00273 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DFFAO00273 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DFFAO00273 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DFFAO00273 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DFFAO00273 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DFFAO00273 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DFFAO00273 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DFFAO00273 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DFFAO00273 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DFFAO00273 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DFFAO00273 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DFFAO00273 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DFFAO00273 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DFFAO00273 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DFFAO00273 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DFFAO00273 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DFFAO00273 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DFFAO00273 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DFFAO00273 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DFFAO00273 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DFFAO00273 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DFFAO00273 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DFFAO00273 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DFFAO00273 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DFFAO00273 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DFFAO00273 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DFFAO00273 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DFFAO00273 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DFFAO00273 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DFFAO00273 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DFFAO00273 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DFFAO00273 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DFFAO00273 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DFFAO00273 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DFFAO00273 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DFFAO00273 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DFFAO00273 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DFFAO00273 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DFFAO00273 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DFFAO00273 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DFFAO00273 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DFFAO00273 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DFFAO00273 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms