Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BHMG1C9JSJ3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHMG1C9JSJ3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.5 ms