Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8A1Q9Y2Q0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms