Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms