Protein–RNA interactions for Protein: Q8N511

TMEM199, Transmembrane protein 199, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM199Q8N511 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM199Q8N511 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM199Q8N511 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM199Q8N511 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM199Q8N511 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM199Q8N511 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM199Q8N511 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM199Q8N511 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM199Q8N511 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM199Q8N511 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms