Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC82Q8N4S0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC82Q8N4S0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms