Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL19A1Q14993 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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