Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 snR56snR56 88 nt3.86□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 RUB1YDR139C 234 nt3.86□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 COBQ0105 1158 nt3.86□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 OTU1YFL044C 906 nt3.86□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt3.86□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 YKE4YIL023C 1041 nt3.86□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 GLG2YJL137C 1143 nt3.86□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 BNA1YJR025C 534 nt3.86□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 YNR062CYNR062C 984 nt3.86□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 PFK27YOL136C 1194 nt3.86□□□□□ -1.79 RIP-Chip
PUF2Q12221 CIK1YMR198W 1785 nt3.86□□□□□ -1.79 RIP-Chip
PUF2Q12221 COP1YDL145C 3606 nt3.85□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 CET1YPL228W 1650 nt3.85□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 RPL13AYDL082W 600 nt3.85□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 YDR271CYDR271C 372 nt3.85□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 SPO73YER046W 432 nt3.85□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 SPI1YER150W 447 nt3.85□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 COX4YGL187C 468 nt3.85□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 RPS0AYGR214W 759 nt3.85□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 SVP26YHR181W 687 nt3.85□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 FMC1YIL098C 468 nt3.85□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt3.85□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 CIN2YPL241C 807 nt3.85□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 STP22YCL008C 1158 nt3.85□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 DIP2YLR129W 2832 nt3.85□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 YVC1YOR087W 2028 nt3.85□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 APN2YBL019W 1563 nt3.85□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 ROK1YGL171W 1695 nt3.84□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 TAF7YMR227C 1773 nt3.84□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 NOG1YPL093W 1944 nt3.84□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 YDR203WYDR203W 318 nt3.84□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 YOS1YER074W-A 258 nt3.84□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 EMC4YGL231C 573 nt3.84□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 GTF1YGR102C 552 nt3.84□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 FOL2YGR267C 732 nt3.84□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 MRPL49YJL096W 486 nt3.84□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 SWD2YKL018W 990 nt3.84□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 RAS1YOR101W 930 nt3.84□□□□□ -1.79 RIP-Chip
PUF2Q12221 YPL077CYPL077C 723 nt3.84□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 VPS38YLR360W 1320 nt3.84□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 BUD6YLR319C 2367 nt3.84□□□□□ -1.79
PUF2Q12221 YPK9YOR291W 4419 nt3.84□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 URK1YNR012W 1506 nt3.84□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 PLM2YDR501W 1566 nt3.84□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 RNA14YMR061W 2034 nt3.83□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 MCM7YBR202W 2538 nt3.83□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 MIS1YBR084W 2928 nt3.83□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 UBC9YDL064W 474 nt3.83□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt3.83□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 MPO1YGL010W 525 nt3.83□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 YGR064WYGR064W 369 nt3.83□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 EFG1YGR271C-A 702 nt3.83□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 COQ5YML110C 924 nt3.83□□□□□ -1.8 RIP-Chip
PUF2Q12221 YNL013CYNL013C 378 nt3.83□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 RUF22RUF22 515 nt3.83□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 YPT53YNL093W 663 nt3.83□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 FMP41YNL168C 780 nt3.83□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 COS1YNL336W 1146 nt3.83□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 YOR364WYOR364W 369 nt3.83□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt3.83□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 ACA1YER045C 1470 nt3.83□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 BI3Q0115 1554 nt3.83□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 ALO1YML086C 1581 nt3.83□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 RAD54YGL163C 2697 nt3.83□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 RTS1YOR014W 2274 nt3.82□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 FAT1YBR041W 2010 nt3.82□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 YGL176CYGL176C 1665 nt3.82□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 RPC11YDR045C 333 nt3.82□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 GRX3YDR098C 858 nt3.82□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 LSM4YER112W 564 nt3.82□□□□□ -1.8 RIP-Chip
PUF2Q12221 PSF3YOL146W 585 nt3.82□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 YOR263CYOR263C 408 nt3.82□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 HSH49YOR319W 642 nt3.82□□□□□ -1.8 RIP-Chip
PUF2Q12221 YPR147CYPR147C 915 nt3.82□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 ERG5YMR015C 1617 nt3.81□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 RSC3YDR303C 2658 nt3.81□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 TAF8YML114C 1533 nt3.81□□□□□ -1.8 RIP-Chip
PUF2Q12221 CBS1YDL069C 690 nt3.81□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 NOP6YDL213C 678 nt3.81□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 RPL27AYHR010W 411 nt3.81□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 IKI1YHR187W 930 nt3.81□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 MMF1YIL051C 438 nt3.81□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 SGN1YIR001C 753 nt3.81□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 MBR1YKL093W 1020 nt3.81□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 MED11YMR112C 396 nt3.81□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 YNL035CYNL035C 1170 nt3.81□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 OSH2YDL019C 3852 nt3.81□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 RPS14AYCR031C 414 nt3.8□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 NHP10YDL002C 612 nt3.8□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 RCR2YDR003W 633 nt3.8□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 YFL051CYFL051C 483 nt3.8□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 SCM4YGR049W 564 nt3.8□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt3.8□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 AIM25YJR100C 984 nt3.8□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 YAL065CYAL065C 387 nt3.8□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 IMP1YMR150C 573 nt3.8□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 RRT1YBL048W 312 nt3.8□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 SGT1YOR057W 1188 nt3.8□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 YOR366WYOR366W 354 nt3.8□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 USV1YPL230W 1176 nt3.8□□□□□ -1.8 RIP-Chip
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