Protein–RNA interactions for Protein: Q05541

NSE3, Non-structural maintenance of chromosome element 3, yeast

Predictions only

Length 303 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NSE3	Q05541	PEX15	YOL044W	1152 nt		4.96	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	YBR053C	YBR053C	1077 nt		4.96	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	LOA1	YPR139C	903 nt		4.96	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	RFC5	YBR087W	1065 nt		4.96	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	ARL1	YBR164C	552 nt		4.96	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	POP7	YBR167C	423 nt		4.96	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	STP22	YCL008C	1158 nt		4.96	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	IZH3	YLR023C	1632 nt		4.96	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	USA1	YML029W	2517 nt		4.95	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	MSW1	YDR268W	1140 nt		4.95	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	YFL012W-A	YFL012W-A	375 nt		4.95	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	TAN1	YGL232W	870 nt		4.95	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	PRP38	YGR075C	729 nt		4.95	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	ATG38	YLR211C	681 nt		4.95	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	ECM13	YBL043W	774 nt		4.95	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	YSF3	YNL138W-A	258 nt		4.95	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	PEX30	YLR324W	1572 nt		4.95	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	PUB1	YNL016W	1362 nt		4.94	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	HO	YDL227C	1761 nt		4.94	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	YLR290C	YLR290C	834 nt		4.94	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	FLD1	YLR404W	858 nt		4.94	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	RIB5	YBR256C	717 nt		4.94	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	YPR148C	YPR148C	1308 nt		4.94	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	RAD18	YCR066W	1464 nt		4.94	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	YTA6	YPL074W	2265 nt		4.93	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	FOL2	YGR267C	732 nt		4.93	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	CFD1	YIL003W	882 nt		4.93	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	DAL2	YIR029W	1032 nt		4.93	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	MRPL49	YJL096W	486 nt		4.93	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	YJL175W	YJL175W	513 nt		4.93	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	SWC7	YLR385C	399 nt		4.93	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	ALO1	YML086C	1581 nt		4.93	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	RRG7	YOR305W	729 nt		4.93	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	MON1	YGL124C	1935 nt		4.93	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	REF2	YDR195W	1602 nt		4.93	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	YBR225W	YBR225W	2703 nt		4.93	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	ISW2	YOR304W	3363 nt		4.92	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	YIL161W	YIL161W	708 nt		4.92	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	RPL14A	YKL006W	417 nt		4.92	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	VMA6	YLR447C	1038 nt		4.92	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	RRP15	YPR143W	753 nt		4.92	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	RDS2	YPL133C	1341 nt		4.92	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	LTV1	YKL143W	1392 nt		4.91	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	YDR230W	YDR230W	348 nt		4.91	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	YFR009W-A	YFR009W-A	258 nt		4.91	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	PGD1	YGL025C	1194 nt		4.91	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	TAD1	YGL243W	1203 nt		4.91	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	YLR202C	YLR202C	327 nt		4.91	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	RDN58-1	RDN58-1	158 nt		4.91	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	RDN58-2	RDN58-2	158 nt		4.91	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	RPS19A	YOL121C	435 nt		4.91	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	MTL1	YGR023W	1656 nt		4.91	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	CLF1	YLR117C	2064 nt		4.91	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	BUD27	YFL023W	2391 nt		4.91	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	EPO1	YMR124W	2832 nt		4.91	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	PCA1	YBR295W	3651 nt		4.91	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	RNA14	YMR061W	2034 nt		4.9	□□□□□ -1.62
NSE3	Q05541	TVP15	YDR100W	432 nt		4.9	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	IES6	YEL044W	501 nt		4.9	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	YGL132W	YGL132W	336 nt		4.9	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	YNL013C	YNL013C	378 nt		4.9	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	PIN3	YPR154W	648 nt		4.9	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	MUD1	YBR119W	897 nt		4.9	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	CDC37	YDR168W	1521 nt		4.9	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	SEC27	YGL137W	2670 nt		4.9	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	OLE1	YGL055W	1533 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	TFB2	YPL122C	1542 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	RAD54	YGL163C	2697 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	SPI1	YER150W	447 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	YGR160W	YGR160W	612 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	RSM25	YIL093C	795 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	SSO2	YMR183C	888 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	IDI1	YPL117C	867 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	POL30	YBR088C	777 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	FAR8	YMR029C	1572 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	EMP47	YFL048C	1338 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	POL1	YNL102W	4407 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	RSC3	YDR303C	2658 nt		4.89	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	ULP1	YPL020C	1866 nt		4.88	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	CHL1	YPL008W	2586 nt		4.88	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	KAP114	YGL241W	3015 nt		4.88	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	UBP12	YJL197W	3765 nt		4.88	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	RPP1A	YDL081C	321 nt		4.88	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	SOL4	YGR248W	768 nt		4.88	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	PEX18	YHR160C	852 nt		4.88	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	MNN11	YJL183W	1269 nt		4.88	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	SRP40	YKR092C	1221 nt		4.88	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	FAR3	YMR052W	615 nt		4.88	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	NRK1	YNL129W	723 nt		4.88	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	XKS1	YGR194C	1803 nt		4.88	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	ATG26	YLR189C	3597 nt		4.88	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	NGG1	YDR176W	2109 nt		4.87	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	YDR248C	YDR248C	582 nt		4.87	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	NKP1	YDR383C	717 nt		4.87	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	YIP5	YGL161C	933 nt		4.87	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	RPS0A	YGR214W	759 nt		4.87	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	CKA1	YIL035C	1119 nt		4.87	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	VPS20	YMR077C	666 nt		4.87	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	KIN3	YAR018C	1308 nt		4.87	□□□□□ -1.63
NSE3	Q05541	BCS1	YDR375C	1371 nt		4.87	□□□□□ -1.63

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