Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHKA1P46020 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHKA1P46020 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PHKA1P46020 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms