Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 TAN1YGL232W 870 nt3.55□□□□□ -1.84
SEC28P40509 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt3.55□□□□□ -1.84
SEC28P40509 SNX4YJL036W 1272 nt3.55□□□□□ -1.84
SEC28P40509 TVP18YMR071C 504 nt3.55□□□□□ -1.84
SEC28P40509 PIN3YPR154W 648 nt3.55□□□□□ -1.84
SEC28P40509 VPS53YJL029C 2469 nt3.55□□□□□ -1.84
SEC28P40509 RAD2YGR258C 3096 nt3.55□□□□□ -1.84
SEC28P40509 VPS17YOR132W 1656 nt3.55□□□□□ -1.84
SEC28P40509 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt3.55□□□□□ -1.84
SEC28P40509 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt3.55□□□□□ -1.84
SEC28P40509 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt3.55□□□□□ -1.84
SEC28P40509 GPI13YLL031C 3054 nt3.55□□□□□ -1.84
SEC28P40509 VIP1YLR410W 3441 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC28P40509 YGR237CYGR237C 2358 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC28P40509 PHO81YGR233C 3537 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC28P40509 RNH202YDR279W 1053 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC28P40509 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC28P40509 YDR526CYDR526C 471 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC28P40509 RPS8BYER102W 603 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC28P40509 RPL1BYGL135W 654 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC28P40509 DCG1YIR030C 735 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC28P40509 YJR128WYJR128W 360 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC28P40509 YLR290CYLR290C 834 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC28P40509 RPS8AYBL072C 603 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC28P40509 HHF1YBR009C 312 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC28P40509 RPS10AYOR293W 318 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC28P40509 YPL035CYPL035C 348 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC28P40509 RPL1AYPL220W 654 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC28P40509 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC28P40509 HRD1YOL013C 1656 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC28P40509 ATG26YLR189C 3597 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC28P40509 YML096WYML096W 1578 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC28P40509 ZDS1YMR273C 2748 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC28P40509 THR4YCR053W 1545 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC28P40509 MDN1YLR106C 14733 nt3.54□□□□□ -1.84
SEC28P40509 RRI1YDL216C 1323 nt3.53□□□□□ -1.84
SEC28P40509 LRS4YDR439W 1044 nt3.53□□□□□ -1.84
SEC28P40509 FOL2YGR267C 732 nt3.53□□□□□ -1.84
SEC28P40509 YIL024CYIL024C 570 nt3.53□□□□□ -1.84
SEC28P40509 IME1YJR094C 1083 nt3.53□□□□□ -1.84
SEC28P40509 GLO1YML004C 981 nt3.53□□□□□ -1.84
SEC28P40509 RPC34YNR003C 954 nt3.53□□□□□ -1.84
SEC28P40509 ATG21YPL100W 1491 nt3.53□□□□□ -1.84
SEC28P40509 MRH4YGL064C 1686 nt3.52□□□□□ -1.85
SEC28P40509 ITT1YML068W 1395 nt3.52□□□□□ -1.85
SEC28P40509 ASI1YMR119W 1875 nt3.52□□□□□ -1.85
SEC28P40509 GTT1YIR038C 705 nt3.52□□□□□ -1.85
SEC28P40509 ANB1YJR047C 474 nt3.52□□□□□ -1.85
SEC28P40509 ARC19YKL013C 516 nt3.52□□□□□ -1.85
SEC28P40509 RNH203YLR154C 333 nt3.52□□□□□ -1.85
SEC28P40509 RSF1YMR030W 1131 nt3.52□□□□□ -1.85
SEC28P40509 RPL13BYMR142C 600 nt3.52□□□□□ -1.85
SEC28P40509 RIB4YOL143C 510 nt3.52□□□□□ -1.85
SEC28P40509 YOR238WYOR238W 912 nt3.52□□□□□ -1.85
SEC28P40509 SPP381YBR152W 876 nt3.52□□□□□ -1.85
SEC28P40509 TFB2YPL122C 1542 nt3.52□□□□□ -1.85
SEC28P40509 ARO1YDR127W 4767 nt3.52□□□□□ -1.85
SEC28P40509 TAF1YGR274C 3201 nt3.51□□□□□ -1.85
SEC28P40509 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.51□□□□□ -1.85
SEC28P40509 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.51□□□□□ -1.85
SEC28P40509 YJR037WYJR037W 384 nt3.51□□□□□ -1.85
SEC28P40509 SEC65YML105C 822 nt3.51□□□□□ -1.85
SEC28P40509 YNL171CYNL171C 369 nt3.51□□□□□ -1.85
SEC28P40509 VAM10YOR068C 345 nt3.51□□□□□ -1.85
SEC28P40509 FDH1YOR388C 1131 nt3.51□□□□□ -1.85
SEC28P40509 IPI3YNL182C 1668 nt3.51□□□□□ -1.85
SEC28P40509 NUP159YIL115C 4383 nt3.51□□□□□ -1.85
SEC28P40509 SEC15YGL233W 2733 nt3.5□□□□□ -1.85
SEC28P40509 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt3.5□□□□□ -1.85
SEC28P40509 RPA14YDR156W 414 nt3.5□□□□□ -1.85
SEC28P40509 PEX10YDR265W 1014 nt3.5□□□□□ -1.85
SEC28P40509 GRX2YDR513W 432 nt3.5□□□□□ -1.85
SEC28P40509 YGR064WYGR064W 369 nt3.5□□□□□ -1.85
SEC28P40509 PTI1YGR156W 1278 nt3.5□□□□□ -1.85
SEC28P40509 SGN1YIR001C 753 nt3.5□□□□□ -1.85
SEC28P40509 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt3.5□□□□□ -1.85
SEC28P40509 SAW1YAL027W 786 nt3.5□□□□□ -1.85
SEC28P40509 IZH4YOL101C 939 nt3.5□□□□□ -1.85
SEC28P40509 TIR2YOR010C 756 nt3.5□□□□□ -1.85
SEC28P40509 snR11snR11 258 nt3.5□□□□□ -1.85
SEC28P40509 FIG1YBR040W 897 nt3.5□□□□□ -1.85
SEC28P40509 MRP2YPR166C 348 nt3.5□□□□□ -1.85
SEC28P40509 PHO88YBR106W 567 nt3.5□□□□□ -1.85
SEC28P40509 RRG1YDR065W 1098 nt3.49□□□□□ -1.85
SEC28P40509 SMT3YDR510W 306 nt3.49□□□□□ -1.85
SEC28P40509 RPS23AYGR118W 438 nt3.49□□□□□ -1.85
SEC28P40509 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.49□□□□□ -1.85
SEC28P40509 YKL162CYKL162C 1209 nt3.49□□□□□ -1.85
SEC28P40509 YLL047WYLL047W 384 nt3.49□□□□□ -1.85
SEC28P40509 HMX1YLR205C 954 nt3.49□□□□□ -1.85
SEC28P40509 YAR070CYAR070C 300 nt3.49□□□□□ -1.85
SEC28P40509 RPS23BYPR132W 438 nt3.49□□□□□ -1.85
SEC28P40509 FLO9YAL063C 3969 nt3.49□□□□□ -1.85
SEC28P40509 ERG9YHR190W 1335 nt3.48□□□□□ -1.85
SEC28P40509 BCD1YHR040W 1101 nt3.48□□□□□ -1.85
SEC28P40509 SDS3YIL084C 984 nt3.48□□□□□ -1.85
SEC28P40509 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt3.48□□□□□ -1.85
SEC28P40509 YJR071WYJR071W 369 nt3.48□□□□□ -1.85
SEC28P40509 SSP2YOR242C 1116 nt3.48□□□□□ -1.85
SEC28P40509 YMR018WYMR018W 1545 nt3.48□□□□□ -1.85
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