Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01549A6NIU2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms