Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRP12Q9Y561 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRP12Q9Y561 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms