Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms