Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SRP68Q9UHB9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRP68Q9UHB9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRP68Q9UHB9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRP68Q9UHB9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRP68Q9UHB9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRP68Q9UHB9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRP68Q9UHB9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRP68Q9UHB9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRP68Q9UHB9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRP68Q9UHB9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRP68Q9UHB9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRP68Q9UHB9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRP68Q9UHB9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRP68Q9UHB9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRP68Q9UHB9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRP68Q9UHB9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRP68Q9UHB9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SRP68Q9UHB9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SRP68Q9UHB9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRP68Q9UHB9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRP68Q9UHB9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131 ms