Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDK12Q9NYV4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDK12Q9NYV4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDK12Q9NYV4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms