Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUBCNQ92622 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUBCNQ92622 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms