Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LRRC9Q6ZRR7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms