Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGU0

TSPO2, Translocator protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPO2Q5TGU0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSPO2Q5TGU0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSPO2Q5TGU0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms