Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH18Q13634 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH18Q13634 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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