Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX1Q01196 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms