Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	PAF1	YBR279W	1338 nt		3.19	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	DAP2	YHR028C	2457 nt		3.19	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	MGR3	YMR115W	1506 nt		3.19	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	UBP5	YER144C	2418 nt		3.19	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	BMH2	YDR099W	822 nt		3.19	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	MTD1	YKR080W	963 nt		3.19	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	MGA1	YGR249W	1371 nt		3.19	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	CHO2	YGR157W	2610 nt		3.19	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	TPD3	YAL016W	1908 nt		3.19	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	VAS1	YGR094W	3315 nt		3.18	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	SLM2	YNL047C	1971 nt		3.18	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	CUE3	YGL110C	1875 nt		3.18	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	ULP1	YPL020C	1866 nt		3.18	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	YIG1	YPL201C	1386 nt		3.18	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	PET54	YGR222W	882 nt		3.18	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	MSA2	YKR077W	1092 nt		3.18	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	MCM16	YPR046W	546 nt		3.18	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	RRN7	YJL025W	1545 nt		3.18	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	MYO3	YKL129C	3819 nt		3.17	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	ALG1	YBR110W	1350 nt		3.17	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	GCN1	YGL195W	8019 nt		3.17	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	RPS18A	YDR450W	441 nt		3.17	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	IRC6	YFR043C	714 nt		3.17	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	DUO1	YGL061C	744 nt		3.17	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	YGR018C	YGR018C	330 nt		3.17	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	YGR149W	YGR149W	1299 nt		3.17	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	RHO5	YNL180C	996 nt		3.17	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	CMD1	YBR109C	444 nt		3.17	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	DRS2	YAL026C	4068 nt		3.17	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	SEA4	YBL104C	3117 nt		3.17	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	IMD4	YML056C	1575 nt		3.17	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	ORC4	YPR162C	1590 nt		3.17	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	TRE2	YOR256C	2430 nt		3.17	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	YIL082W-A	YIL082W-A	4497 nt		3.16	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	ISM1	YPL040C	3009 nt		3.16	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	MRH1	YDR033W	963 nt		3.16	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	PPH3	YDR075W	927 nt		3.16	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	SHU2	YDR078C	672 nt		3.16	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	YDR222W	YDR222W	1248 nt		3.16	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	DOG2	YHR043C	741 nt		3.16	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	RPL17A	YKL180W	555 nt		3.16	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	RAD10	YML095C	633 nt		3.16	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	YBL039W-B	YBL039W-B	180 nt		3.16	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	YMR294W-A	YMR294W-A	360 nt		3.16	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	YNR068C	YNR068C	819 nt		3.16	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	TPK2	YPL203W	1143 nt		3.16	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	PRM15	YMR278W	1869 nt		3.16	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	CSR2	YPR030W	3366 nt		3.15	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	CDC40	YDR364C	1368 nt		3.15	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	CLG1	YGL215W	1359 nt		3.15	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	HAP4	YKL109W	1665 nt		3.15	□□□□□ -1.9
ATG12	P38316	GRX6	YDL010W	696 nt		3.15	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	NSE3	YDR288W	912 nt		3.15	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	GEP4	YHR100C	558 nt		3.15	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	CAB2	YIL083C	1098 nt		3.15	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	MRPL49	YJL096W	486 nt		3.15	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	RPL8B	YLL045C	771 nt		3.15	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	RPS12	YOR369C	432 nt		3.15	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	snR34	snR34	203 nt		3.15	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	ENA2	YDR039C	3276 nt		3.15	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	ENA1	YDR040C	3276 nt		3.15	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	RSM23	YGL129C	1353 nt		3.14	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	YGR117C	YGR117C	1431 nt		3.14	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	YCL076W	YCL076W	744 nt		3.14	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	BSC2	YDR275W	708 nt		3.14	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	YHR214C-E	YHR214C-E	300 nt		3.14	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	POG1	YIL122W	1056 nt		3.14	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	YIL175W	YIL175W	318 nt		3.14	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	RPC17	YJL011C	486 nt		3.14	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	YJL222W-B	YJL222W-B	138 nt		3.14	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	PIR1	YKL164C	1026 nt		3.14	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	YAR070C	YAR070C	300 nt		3.14	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	OCA2	YNL056W	594 nt		3.14	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	UAF30	YOR295W	687 nt		3.14	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	YOR314W	YOR314W	330 nt		3.14	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	HPA2	YPR193C	471 nt		3.14	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	YBR242W	YBR242W	717 nt		3.14	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	MRPL37	YBR268W	318 nt		3.14	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	RGC1	YPR115W	3252 nt		3.14	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	CHS2	YBR038W	2892 nt		3.14	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	VAC8	YEL013W	1737 nt		3.13	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	DSN1	YIR010W	1731 nt		3.13	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	YPS6	YIR039C	1614 nt		3.13	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	WBP1	YEL002C	1293 nt		3.13	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	YGR026W	YGR026W	837 nt		3.13	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	tQ(UUG)B	tQ(UUG)B	72 nt		3.13	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	YJR128W	YJR128W	360 nt		3.13	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	YAL064W-B	YAL064W-B	381 nt		3.13	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	RNH203	YLR154C	333 nt		3.13	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	CSM3	YMR048W	954 nt		3.13	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	NDJ1	YOL104C	1059 nt		3.13	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	snR17a	snR17a	333 nt		3.13	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	SCD6	YPR129W	1050 nt		3.13	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	NSP1	YJL041W	2472 nt		3.13	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	AEP3	YPL005W	1821 nt		3.12	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	YDR250C	YDR250C	276 nt		3.12	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	PHM6	YDR281C	315 nt		3.12	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	YGL082W	YGL082W	1146 nt		3.12	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	USE1	YGL098W	738 nt		3.12	□□□□□ -1.91
ATG12	P38316	SAY1	YGR263C	1275 nt		3.12	□□□□□ -1.91

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