Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TAF1P21675 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TAF1P21675 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF1P21675 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF1P21675 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF1P21675 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF1P21675 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF1P21675 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF1P21675 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF1P21675 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF1P21675 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF1P21675 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF1P21675 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TAF1P21675 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TAF1P21675 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TAF1P21675 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TAF1P21675 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TAF1P21675 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TAF1P21675 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TAF1P21675 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TAF1P21675 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TAF1P21675 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TAF1P21675 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TAF1P21675 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TAF1P21675 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TAF1P21675 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TAF1P21675 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TAF1P21675 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAF1P21675 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAF1P21675 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAF1P21675 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAF1P21675 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAF1P21675 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAF1P21675 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAF1P21675 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAF1P21675 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAF1P21675 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAF1P21675 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAF1P21675 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAF1P21675 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAF1P21675 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TAF1P21675 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TAF1P21675 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TAF1P21675 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TAF1P21675 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TAF1P21675 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TAF1P21675 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TAF1P21675 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TAF1P21675 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TAF1P21675 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TAF1P21675 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TAF1P21675 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TAF1P21675 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TAF1P21675 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF1P21675 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF1P21675 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF1P21675 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF1P21675 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF1P21675 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF1P21675 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF1P21675 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF1P21675 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF1P21675 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF1P21675 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF1P21675 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF1P21675 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF1P21675 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF1P21675 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF1P21675 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1P21675 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1P21675 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1P21675 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1P21675 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1P21675 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1P21675 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1P21675 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1P21675 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1P21675 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1P21675 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1P21675 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1P21675 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1P21675 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1P21675 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TAF1P21675 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF1P21675 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF1P21675 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF1P21675 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF1P21675 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF1P21675 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF1P21675 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF1P21675 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF1P21675 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF1P21675 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF1P21675 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF1P21675 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF1P21675 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF1P21675 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF1P21675 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF1P21675 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF1P21675 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms