Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RXRAP19793 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RXRAP19793 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RXRAP19793 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RXRAP19793 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RXRAP19793 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RXRAP19793 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RXRAP19793 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RXRAP19793 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RXRAP19793 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RXRAP19793 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRAP19793 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRAP19793 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRAP19793 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRAP19793 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRAP19793 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRAP19793 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRAP19793 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRAP19793 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRAP19793 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRAP19793 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRAP19793 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RXRAP19793 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RXRAP19793 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RXRAP19793 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RXRAP19793 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RXRAP19793 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RXRAP19793 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RXRAP19793 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RXRAP19793 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RXRAP19793 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RXRAP19793 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RXRAP19793 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RXRAP19793 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RXRAP19793 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RXRAP19793 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RXRAP19793 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RXRAP19793 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RXRAP19793 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RXRAP19793 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RXRAP19793 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RXRAP19793 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RXRAP19793 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RXRAP19793 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RXRAP19793 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RXRAP19793 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RXRAP19793 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RXRAP19793 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RXRAP19793 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RXRAP19793 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RXRAP19793 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RXRAP19793 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RXRAP19793 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RXRAP19793 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RXRAP19793 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RXRAP19793 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RXRAP19793 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RXRAP19793 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RXRAP19793 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RXRAP19793 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RXRAP19793 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RXRAP19793 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RXRAP19793 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RXRAP19793 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RXRAP19793 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RXRAP19793 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RXRAP19793 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RXRAP19793 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RXRAP19793 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RXRAP19793 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RXRAP19793 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RXRAP19793 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RXRAP19793 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RXRAP19793 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RXRAP19793 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RXRAP19793 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RXRAP19793 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RXRAP19793 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RXRAP19793 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RXRAP19793 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RXRAP19793 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RXRAP19793 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RXRAP19793 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RXRAP19793 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RXRAP19793 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RXRAP19793 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RXRAP19793 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RXRAP19793 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RXRAP19793 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RXRAP19793 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RXRAP19793 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RXRAP19793 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RXRAP19793 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RXRAP19793 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RXRAP19793 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RXRAP19793 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RXRAP19793 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RXRAP19793 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RXRAP19793 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RXRAP19793 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
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