Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BHMG1C9JSJ3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHMG1C9JSJ3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms