Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CFAP69A5D8W1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP69A5D8W1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171 ms