Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E4

PCDHB5, Protocadherin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB5Q9Y5E4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHB5Q9Y5E4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms