Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC17A6Q9P2U8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC17A6Q9P2U8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC17A6Q9P2U8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC17A6Q9P2U8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC17A6Q9P2U8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC17A6Q9P2U8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC17A6Q9P2U8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC17A6Q9P2U8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC17A6Q9P2U8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC17A6Q9P2U8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC17A6Q9P2U8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC17A6Q9P2U8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC17A6Q9P2U8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC17A6Q9P2U8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC17A6Q9P2U8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC17A6Q9P2U8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC17A6Q9P2U8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC17A6Q9P2U8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC17A6Q9P2U8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC17A6Q9P2U8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC17A6Q9P2U8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC17A6Q9P2U8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC17A6Q9P2U8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC17A6Q9P2U8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC17A6Q9P2U8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC17A6Q9P2U8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC17A6Q9P2U8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC17A6Q9P2U8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC17A6Q9P2U8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC17A6Q9P2U8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms