Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PDP2Q9P2J9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDP2Q9P2J9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDP2Q9P2J9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDP2Q9P2J9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDP2Q9P2J9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDP2Q9P2J9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDP2Q9P2J9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDP2Q9P2J9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDP2Q9P2J9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDP2Q9P2J9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDP2Q9P2J9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDP2Q9P2J9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDP2Q9P2J9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDP2Q9P2J9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDP2Q9P2J9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDP2Q9P2J9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDP2Q9P2J9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDP2Q9P2J9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDP2Q9P2J9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDP2Q9P2J9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDP2Q9P2J9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDP2Q9P2J9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDP2Q9P2J9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDP2Q9P2J9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDP2Q9P2J9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDP2Q9P2J9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDP2Q9P2J9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDP2Q9P2J9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDP2Q9P2J9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms