Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK7

C19orf12, Protein C19orf12, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf12Q9NSK7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C19orf12Q9NSK7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C19orf12Q9NSK7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms