Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX30

SCUBE3, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE3Q8IX30 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms