Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX30

SCUBE3, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 993 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE3Q8IX30 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCUBE3Q8IX30 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms