Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC93Q567U6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC93Q567U6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms