Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP25-1Q3LHN0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms