Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIF1AQ16665 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIF1AQ16665 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms